Здравствуйте! Положения действующего законодательства не содержат такого понятия как «партнерский договор». Исходя из практики, чаще всего партнерским договором называют договор простого товарищества. В рассматриваемой ситуации заключение договора простого товарищества невозможно, поскольку согласно положениям ст. 1041 ГК РФ стороной такого договора может являться только коммерческая организация, в то время как ФБУ является некоммерческой организацией. Руководствуясь принципом свободы договора, стороны все же могут заключить договор, определяющий основные правила взаимодействия сторон в процессе разработки и реализации продукта (вопросы распределения денежных средств от реализации, распределение прав на результаты интеллектуальной деятельности, условия лицензирования продукта и т.п.). По своей правовой природе подобное соглашение наиболее близко к рамочному договору, предусмотренному положениями ст. 429.1 ГК РФ (договор, определяющий общие условия обязательственных взаимоотношений сторон, которые могут быть конкретизированы и уточнены сторонами путем заключения отдельных договоров, подачи заявок одной из сторон или иным образом). При заключении бюджетным учреждением подобного рода соглашения, вероятнее всего, потребуется согласование с уполномоченным органом. В процессе реализации государственных программ ФБУ зачастую заключают предварительные договоры со сторонними организациями. Только после одобрения указанного соглашения уполномоченным органом у ФБУ появляется право на заключение основного договора. Бюджетное учреждение вправе осуществлять виды деятельности, не являющиеся для него основными, только для достижения целей, ради которых оно создано, и соответствующие указанным целям, при условии, что такая деятельность указана в его учредительных документах. Более глубокие рекомендации можно дать только на основе детальной информации о фактических обстоятельствах Вашей ситуации.