Вы совершенно правы: не предоставляя отпуск в полном размере, работодатель будет нарушать Ваши права. Действительно, в соответствии со ст. 302 ТК РФ работникам, выезжающим для выполнения работ вахтовым методом в районы Крайнего Севера и приравненные к ним местности из других районов:
предоставляется ежегодный дополнительный оплачиваемый отпуск в порядке и на условиях, которые предусмотрены для лиц, постоянно работающих: в районах Крайнего Севера, - 24 календарных дня.
Как видно из приведенной нормы, законодатель специально подчеркивает, что даже если работники выезжают на вахту в районы Крайнего Севера из других районов (не северных), ежегодный дополнительный отпуск предоставляется им как для работников, постоянно работающих в районах Крайнего Севера, без каких-либо изъятий.
Такое регулирование обусловлено тем, что, как Вы верно отметили, несмотря на то, что междувахтовый отдых проходит в южных районах, рабочее время полностью проводится в районах Крайнего Севера.