Хранения акций, выпускаемых исключительно в бездокументарной форме, как явления не существует - за отсутствием при этом сертификатов акций, в связи с чем речь может идти лишь о различиях порядка учёта прав на акции на счетах депо в депозитарии или на лицевых счетах в реестре акционеров.
По общему правилу учет прав на акции осуществляется в реестре акционеров (ст.44 ФЗ «О акционерных обществах»), в то время как учёт в депозитарии предполагает необходимость заключения акционером с депозитарием депозитарного договора (договора о счете депо), на основании которого депозитарий имеет право регистрироваться в системе ведения реестра в качестве номинального держателя (ст.7 ФЗ «О рынке ценных бумаг»).
Наиболее зримые преимущества учета акций в депозитарии проявляются только в случае, когда акционер в соответствии с условиями депозитарного договора поручает осуществление своих прав депозитарию, который в качестве профессионального участника рынка ценных бумаг способен в большей мере обеспечить защиту прав акционера, нежели он сам.