Да, работодатель имеет такое право. По разъяснениям специалистов Роструда возможно сочетание режимов ненормированного рабочего дня с установленным неполным рабочим днем (Письмо Роструда от 19.04.2010 N 1073-6-1 "Об индексации заработной платы и возможности установления ненормированного рабочего дня работникам с неполным рабочим временем").
Согласно ст. 101 Трудового кодекса РФ условие о ненормированном рабочем дне, содержащееся в трудовых договорах работников, можно понимать как право работодателей привлекать работников к выполнению работы за пределами установленного для них режима рабочего времени. Невозможность отказаться от выполнения работ за пределами установленной продолжительности рабочего времени и связанные с этим неудобства компенсируются предоставлением дополнительного отпуска продолжительностью не менее 3 календарных дней (ст. 119 Трудового кодекса РФ).