Увольнение работника, которого вы замещали, по сокращению не является основанием прекращения вашего контракта. Согласно ст.35 ФЗ «О государственной гражданской службе Российской Федерации» срочный служебный контракт, заключенный на период замещения отсутствующего гражданского служащего, расторгается с выходом этого гражданского служащего на службу. Выхода на службу в данной ситуации не было, поэтому и срок контракта не истек. Исключений для применения нормы ТК о сокращении применительно к вашей должности нет, поэтому с вами также можно расторгнуть договор по сокращению.