Установленный законом порядок исключает возможность произвести передачу акций решением суда, поскольку предполагает обязательность соответствующего волеизъявления со стороны их отчуждателя путём заполнения (вместе с приобретателем) поручения на исполнение депозитарием операции перевода ценных бумаг, как это и требуется в Вашем случае (ст.29 ФЗ «О рынке ценных бумаг»).
Лишь в случае необоснованного уклонения депозитария от исполнения поручения его отказ может быть оспорен в суде.
Следует при этом заметить, что обязать самого продавца решением суда к передаче имущества (исполнить в натуре) можно лишь в том случае, когда речь идёт об индивидуально-определенной вещи (ст.ст. 463 и 398 Гражданского Кодекса РФ), свойствами которой акции не обладают.