Под «помилованием по амнистии» Вы, вероятно, подразумеваете освобождение от уголовной ответственности актом амнистии.
Однако данное обстоятельство, как и обстоятельство наличия или отсутствия судимости, в рассматриваемом случае не имеет значения для определения права на занятие педагогической деятельностью.
Согласно ст. 331 ТК РФ к педагогической деятельности не допускаются не только лица, имеющие или имевшие судимость за преступления против жизни и здоровья, к коим относится преступление, предусмотренное ст. 116 УК РФ, но и лица, подвергавшиеся
уголовному преследованию (за исключением лиц, уголовное преследование в отношении которых прекращено по реабилитирующим основаниям).
Поскольку освобождение от уголовной ответственности актом амнистии не является реабилитирующим основанием, занятие педагогической деятельностью при данных обстоятельствах запрещено нормами ТК РФ.