Сразу оговорюсь, что полноценно ответить на этот вопрос можно только после детально изучения договора с Администрацией и договора между обществами, а вернее условий его прекращения. Применительно к Вашей ситуации претензии вполне могут быть признаны обоснованными, ведь ООО «1» не подписывало соответствующий протокол, а для ООО «2» заказчиком является именно ООО «1», а не Администрация. Тут важным будет обратить внимание на условия прекращения договора между ООО и условия освобождения от ответственности исполнителя. Фактические обстоятельства говорят о невозможности исполнения контракта договора со стороны ООО «2» в этот период. В такой ситуации можно занять позицию о совершении всеми сторонами по сделке конклюдентных действий, направленных на прекращение отношений по договорам, а именно: - со стороны Администрации и ООО «2» – подписание протокола; - со стороны ООО «1» – расторжение договора с администрацией со ссылкой на данный протокол.