Да, можете. Прекращение срочного трудового договора, заключенного на время исполнения обязанностей отсутствующего работника, в связи с выходом этого работника на работу (ч. 3 ст. 79 ТК РФ) не является увольнением по инициативе работодателя. После увольнения основного работника у работодателя отсутствует основание для прекращения трудового договора с вами, поскольку основной работник не выйдет. А вот уволить замещающего вас работника работодатель вправе после вашего выхода на работу.