Сотрудники ЗАГС неверно толкуют п. 2 ст. 48 СК РФ. Ключевое условие данной нормы – если ребенок родился от лиц, состоящих в браке. Отцом же ребенка, в действительности, ваш супруг (бывший) не является. Вам необходимо ссылаться на п. 2 ст. 51 СК РФ, согласно которому если родители не состоят в браке между собой, запись о матери ребенка производится по заявлению матери, а запись об отце ребенка - по совместному заявлению отца и матери ребенка, или по заявлению отца ребенка (п. 3 ст. 48 настоящего Кодекса), или отец записывается согласно решению суда. Аналогичная норма содержится в п. 3 ст. 48 СК РФ – отцовство лица, не состоящего в браке с матерью ребенка, устанавливается путем подачи в орган записи актов гражданского состояния совместного заявления отцом и матерью ребенка. Соответственно, Вам совместно с биологическим отцом ребенка, необходимо подать соответствующее заявление. В случае отказа, необходимо требовать такой отказ в письменной форме и в дальнейшем обжаловать его в судебном порядке.