В данной ситуации исковое подается в Арбитражный суд по общим правилам. При этом суд не должен оставить заявление без рассмотрения на основании п. 5 ч. 1 ст. 148 АПК РФ, поскольку согласно этой же норме соглашение сторон о рассмотрении спора третейским судом не может быть исполнено.