Исходя из имеющейся в Вашем вопросе информации речь идет о преобразовании, которое произошло в других субъектах в середине 2000-х годов.
Данное преобразование означает, что Управление Минюста по Республике Калмыкия стало территориальным подразделением федерального органа государственной власти РФ, а именно, Министерства юстиции Российской Федерации.
Следовательно, сотрудники являются после преобразования не государственными гражданскими служащими Республики, а федеральными служащими. На них теперь не распространяется республиканский закон о государственной службе (предусмотренные им выплаты, надбавки и т.п.), а только федеральное служебное право.
В частности – Федеральный закон «О системе государственной службы», ФЗ «О государственной гражданской службе».