Здравствуйте, Татьяна. Повторное предоставление справки не требовалось, поскольку при реорганизации трудовые отношения с сотрудниками продолжаются в силу ст. 75 Трудового кодекса РФ (в трудовую книжку лишь вносятся изменения наименования организации (речь не должна идти об увольнении или переводе) и с работником заключается дополнительное соглашение). А все права и обязанности переходят к вновь созданной организации (в т.ч. и все кадровые документы). Администрация должна предоставить Вашему отцу неиспользованные дни отпуска и выплатить отпускные.
Увольнение возможно только в том случае, если изменится группа инвалидности, при невозможности перевести работника на другую работу.
Обратите внимание на записи в трудовой книжке (дополнительном соглашении к трудовому договору), если в них отражена описанная мною ситуация, и если работодатель продолжает настаивать на своей позиции, то следует обратиться в Государственную инспекцию труда, прокуратуру.