Приватизировав квартиру в 1997 году Вы приобрели её в общую долевую собственность. После смерти Вашей матери в 1998 году, было открыто наследство. Мнения, которые Вы встречали на форумах, согласно которым невостребованная доля становится муниципальной собственностью, основаны на ныне действующем законодательстве, а именно на части III Гражданского Кодекса РФ. Однако, часть III Гражданского кодекса РФ в данном случае не применима, поскольку последняя вступила в силу только в 2002 году. В Вашем случае подлежат применению нормы более раннего законодательства, а именно положения Гражданского Кодекса РСФСР 1964 года.
После открытия наследства наследники должны его принять. При отсутствии завещания имущество, подлежащее наследованию, распределяется между всеми наследниками, принявшими наследство, поровну. Ваш отец, продолжая жить в квартире, оплачивая коммунальные платежи, фактически вступил в наследство (ст. 546 ГК РСФСР). Поскольку все остальные наследники не вступили в наследство, всё наследственное имущество перешло к Вашему отцу. В связи с этим Ваш отец обладает 2/3 долей в общей долевой собственности на приватизированную в 1997 году квартиру, а Вы обладаете 1/3 долей.